ERP (alebo ekonomický systém) predstavuje softvér pre riadenie podniku. V spojitosti s e-shopmi ide najčastejšie o účtovné programy, ktoré je možné s e-shopmi prepojiť a zdieľať tak informácie o faktúrach, dobropisoch, objednávkach, produktoch, kategóriách a pod.
Zoznam podporovaných ERP systémov Shoptecu nájdete v cenníku, prípadne si o ich použití môžete prečítať v manuáli.